La periodista era conocida por sus críticas al Kremlin y al presidente de Rusia, Vladimir Putin. En la revista moscovita Nóvaya Gazeta, la reportera escribió numerosos artículos críticos sobre la segunda guerra de Chechenia, iniciada en agosto de 1999. En ellos, Politkóvskaya describe los abusos cometidos por las fuerzas militares rusas, por rebeldes chechenos y por la administración de Grozni respaldada por Moscú y dirigida por Ajmat Kadírov y su hijo Ramzán.
Además, Anna Politkóvskaya reveló las violaciones de los derechos humanos y abusos policiales en Chechenia y en otras regiones rusas del Cáucaso norte en libros como Chechenia, la deshonra rusa de 2003 y La Rusia de Putin de 2004. Debido a su trabajo por denunciar los abusos de los Kadírov y sus socios en el Kremlin, Politkóvskaya fue amenazada en repetidas ocasiones hasta que el 7 de octubre de 2006 fue tiroteada en el portal de su casa.
Cuatro disparos con una pistola Makárov segaron ayer en Moscú la vida. El asesino, un tipo delgado con un gorro calado, según la cámara de vídeo de vigilancia que no registró bien su imagen, la esperaba en el portal de su casa en el centro de Moscú. La mató y la remató en el suelo del ascensor, donde la encontró una vecina poco después. Todo ocurrió a las cinco de la tarde, cuando Politkóvskaya regresaba de hacer sus compras. La periodista iba a volver a salir, porque los paquetes se quedaron en el asiento de atrás del coche que había aparcado frente a su vivienda.